EVALUACIÓN DE LA VARIABILIDAD GENÉTICA EN UNA POBLACIÓN DEL PECTÍNIDO Argopecten nucleus MEDIANTE MARCADORES MICROSATÉLITES

  • Judith Barros- Gómez
Palabras clave: Scallops, DNA, PCR, SSR, standardization, bivalve

Resumen

Introducción. Argopecten nucleus es un pectínido del Caribe que se cultiva en la Bahía de Taganga (Santa Marta, Colombia), a partir de semilla producida en hatchery.  Su condición de hermafrodita simultáneo con fecundidad externa, baja densidad de sus poblaciones naturales, así como la utilización recurrente de reproductores producidos en hatchery para el mantenimiento de su cultivo, hacen que exista un riesgo de endogamia en las poblaciones naturales y de cultivo.  Objetivo. Con el fin de proveer una herramienta molecular que permita estudiar la variabilidad genética de las mismas, en el presente estudio se aislaron y estandarizaron por primera vez, ocho marcadores microsatélites para la especie A. nucleus y con base en estos fue evaluada la variabilidad genética de una población de Bahía Neguanje (Santa Marta, Colombia).  Métodos. Para obtener los microsatélites se extrajeron muestras de ADN del músculo aductor (1 cm2 conservado en etanol al 99%) de 10 ejemplares de A. nucleus (43,6 ± 4,3 mm) producidos en hatchery por fecundación cruzada en el Laboratorio de Moluscos y Microalgas de la Universidad del Magdalena y cultivados en sistema suspendido en la Bahía de Taganga (Santa Marta). A un total de 60 ejemplares silvestres de A. nucleus (41,2 ± 1,8 mm) obtenidos sobre colectores artificiales y cultivados en sistema suspendido en Bahía Neguanje, Santa Marta, se les tomó una muestra de manto (0.5 cm2) de la cual se extrajo el ADN siguiendo el protocolo de Lopera et al. (2008), reemplazando el cloruro de sodio por acetato de amonio, para la evaluación de los microsatélites Resultados: Se obtuvo una librería genómica con 300 secuencias SSR. Las temperaturas de anillaje (Tm) para los 8 loci con mayor número de repeticiones de nucleótidos oscilaron entre 50,3 y 51,0 °C.  Las frecuencias alélicas variaron entre 0,009 y 0,632, el número de alelos por locus (Na) entre 3 y 8 y la riqueza alélica entre 3,000 y 7,755. La heterocigosidad observada (Ho) varió entre 0 y 0,69, mientras que la esperada (He) estuvo entre 0,527 y 0,786, encontrándose que todos los loci están en desequilibrio Hardy-Weinberg y hay presencia de alelos nulos.  Conclusiones: El alto polimorfismo encontrado en los 8 loci aislados, los hace una herramienta potente para su aplicación en estudios de variabilidad genética de poblaciones y análisis de paternidad. Los resultados del uso de estos marcadores sugieren que la población natural estudiada está sujeta a una depresión por consanguinidad, lo que alerta la necesidad de implementar acciones que promuevan el incremento de la variabilidad genética en las poblaciones de cultivo y/o naturales.

 Palabras clave: Scallops, ADN, PCR, SSR, estandarización, bivalvo

EVALUATION OF GENETIC VARIABILITY IN A POPULATION OF SCALLOPS Argopecten nucleus BY MICROSATELLITE MARKERS

 

Descargas

La descarga de datos todavía no está disponible.
Publicado
2016-12-06